國產云端MD引擎SPONGE上線！并行科技聯合北大、深圳灣實驗室推動科研創新

　　多學科交叉融合的科研時代，分子動力學(MD)模擬已成為化學、生物醫藥、材料科學等領域不可或缺的工具。然而，傳統MD軟件長期依賴國外技術，且面對大規模復雜體系模擬時，算力與效率瓶頸日益凸顯。在此背景下，并行科技攜手北京大學化學與分子學院高毅勤教授團隊、深圳灣實驗室系統物理生物學所楊奕課題組，成功完成國產分子動力學模擬引擎SPONGE的云端部署，標志著我國在自主可控的高性能計算與分子模擬領域取得重要突破。

　　強強聯合：技術自主化與算力升級的雙重突破

　　此次合作中，北京大學與深圳灣實驗室主導SPONGE核心算法研發，其創新的GPU加速技術及AI驅動的增強采樣方法(如元動力學、深度學習潛力集成等)，顯著提升了模擬精度與速度;并行科技則依托其強大的云端算力平臺，為SPONGE提供高性能計算資源支持，使其能夠高效處理超大規模分子體系(如蛋白質-配體相互作用、納米材料表面動力學等場景)，同時支持多任務并行計算，大幅降低科研成本與時間。

　　這一合作不僅填補了國產MD軟件在云端高性能計算領域的空白，更通過技術開源與模塊化設計(如MindSPONGE與華為MindSpore框架深度結合)，為跨學科研究提供了靈活擴展的解決方案。

　　操作步驟一：并行云桌面登錄界面

　　操作步驟二：點擊SPONGE

　　步驟三：按需在SPONGE作業列表界面進行相關作業操作

　　步驟四：選擇作業規模并提交

　　用戶收益：從科研到產業的全鏈條賦能

　　1. 效率躍升：

　　SPONGE的GPU加速技術使模擬速度提升10倍以上，結合云端彈性算力，用戶可快速完成傳統需數周的計算任務，尤其適用于藥物發現、新材料設計等時效性強的領域。

　　2. 精度與功能擴展：

　　與國外主流軟件(如Amber)精度持平，且支持復雜體系(如生物大分子、特殊材料表面)的定制化模擬，滿足前沿研究需求。

　　3. 成本優化：

　　云端部署無需本地高性能硬件投入，按需付費模式降低中小團隊使用門檻，助力普惠科研。

　　4. 生態開放：

　　模塊化設計(CudaSPONGE、MindSPONGE、Xponge)支持與深度學習、分子對接工具(如DSDP)無縫集成，推動AI for Science的深度融合。

　　案例實證：SPONGE的多元應用場景

　　-生物醫藥：精準模擬蛋白質構象變化，加速靶向藥物篩選;

　　-材料科學：解析納米材料表面動力學行為，指導高性能材料開發;

　　-教育領域：開源特性助力高校教學與科研訓練，培養交叉學科人才。

　　SPONGE與國外主流軟件Amber計算精度上無顯著差異

　　SPONGE在生物大分子體系模擬表現良好

　　SPOGNE甚至可以用于一些特殊材料體系表面信息的定制化計算

　　SPONGE的云端部署不僅是國產科研軟件向“云上科研”發展的又一次有力實踐，更展現了并行科技致力于算力行業產學研多元合作的核心價值——通過技術自主化與算力資源整合，為科研機構與企業提供高效、靈活、低成本的分子模擬工具。

　　未來，隨著算法與算力的持續迭代，SPONGE有望成為MD模擬領域的重要參與者，推動我國在生物醫藥、新材料等戰略產業的核心競爭力提升。